一种算法可以预测胶原蛋白的结构和熔化温度胶原蛋白是三螺旋

一种算法可以预测胶原蛋白的结构和熔化温度，胶原蛋白是三螺旋

胶原蛋白是生物蛋白之王，现在它具有SCEPTTr。

赖斯大学的科学家开发了一种算法，研究天然和合成形式的胶原蛋白。胶原蛋白约占人体蛋白质的三分之一，并在皮肤，骨骼，肌肉，肌腱和韧带中形成纤维状胶中国化工网okmart.com。

该程序-胶原蛋白模拟肽的转变温度的全称，计分功能-准确预测胶原蛋白三螺旋的稳定性，胶原三螺旋是形成原纤维的主要结构。

由化学家，生物工程师Jeffrey Hartgerink和研究生Douglas Walker领导的Rice团队根据他们自己的实验和文献资料对431个胶原三倍螺旋进行了SCEPTTr测试，并以此为指导来设计新型合成胶原螺旋。

研究人员说，《自然化学》中的这项研究可以帮助研究人员更好地了解关键蛋白在伤口愈合和癌症中的作用，并可以用于设计合成胶原蛋白。

该论文大大改善了实验室2012年预测合成胶原蛋白结构稳定性的项目。Hartgerink说：“它的局限之一是它只了解非常狭窄的氨基酸。”

SCEPTTr将其扩展到整个天然氨基酸阵列。从本质上讲，这使它成为用于胶原蛋白设计的Erector套装，在台式计算机上可能会折磨数周的试验和错误，甚至缩短到几秒钟。

“第二个主要改进是，尽管早期的研究无法告诉您某种胶原蛋白在室温下是否稳定，但道格的程序可以预测熔融温度，即三螺旋分解的温度。” 。“最重要的是，它是一个易于测试的值，并且可以扩展到生理温度。

他说：“这对我们很重要，因为如果将它放进活的生物体内时会散开的话，它并不是特别有用。”

对于给定的三个序列，SCEPTTr返回的结果不只是单个结果，它详细说明了输入肽的所有可能组合，并为每个肽提供了解链温度。

Walker说：“ SCEPTTr做的最重要的事情之一就是查看所有可能的替代结构，并告诉您这些结构的稳定性。” “这有助于我们在制作这些复杂混合物之前先了解它们的外观。”

沃克为该项目带来了独特的人才组合，其中一半时间用于合成胶原蛋白肽，另一半用于SCEPTTr。

他解释说：“当我还是一名本科生（在爱达荷州立大学学习化学）时，我一直参加数学课程，因为我真的很喜欢它。” “到了我想到的地步，'好吧，我距离数学未成年人只有一堂课。' 那恰好是一门计算机科学课程。”

尽管有所保留，Walker发现他喜欢编程。“很早以前，我说，'嘿，道格，您对计算机一无所知，因为我有一个专为您设计的项目，'”哈特格林克回忆说。“我认为，如果他不了解编程，他将不得不以一种或另一种方式弄清楚。”

沃克说，该计划将在网上免费提供。他说：“我们希望使它成为一个更容易接近的领域，SCEPTTr应该使人们更容易理解胶原蛋白。”

国家科学基金会，罗伯特·A·韦尔奇基金会和Stauffer-Rothrock奖学金对这项研究提供了支持。